MeDIP測序

MeDIP-seq:利用MeDIP技術富集甲基化的DNA片段,再利用大規模測序技術測序。研究者可以較小的數據量,快速高通量地發現靶基因組上的甲基化區域。應用領域:DNA甲基化研究; 比較不同細胞、組織、疾病樣本間的DNA甲基化修飾模式的差異;DMRs(甲基化差異區域)的研究。

應用領域

樣本間DNA甲基化修飾差異分析
大樣本量疾病研究

技術路線

分析內容

1. 標準信息分析
對測序結果進行base calling、raw data 數據整理及數據質量評估
2. 高級信息分析
   a)  MeDIP-seq序列與參考序列的對比
   b)  MeDIP-seq序列數據在全基因的分布趨勢
   c)  統計MeDIP-seq序列富集區域(peak)的信息
   d)  基于Peak的多樣品間差異分析
   e)  可結合客戶的需求,協商確定個性化信息分析內容

樣品要求

樣品需求量:總量≥5μg,濃度≥50ng/μL;
樣品完整性:DNA無明顯降解,需提供凝膠電泳檢測膠圖

項目周期

完成時間:單個樣品標準流程(上圖)的運轉周期約為55個工作日。遇樣品數較多時,項目周期根據項目規模而定。
完成標準:產生不少于合同的clean data

參考文獻

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